В интернете много статей, как к уже существующей системе Апач+mySQL+php добавляется nginx, как фронд-енд. При этом выставляется редирект с 80 порта на порт Nginx. Однако в процессе использования такой схемы нашелся один маленький баг.
Дело в том, что если использовать конструкцию
deny from IP в .htaccess.

Немного подумав я нашел интересное решение
RewriteEngine on
RewriteCond %{REMOTE_ADDR} (IP1|IP2|IP3)
RewriteRule . /index.php [F]

Работает на 100%